第二届国产CPU并行应用挑战赛颁奖晚宴在青岛隆重举行大赛详情：http://www.52jingsai.com/article-4745-1.html获奖队伍名单金奖山东大学 多喝热水多看文档队陈国良院士、吴立新院士、王英龙研究员为金奖获奖队颁奖银 ...
第二届国产CPU并行应用挑战赛颁奖晚宴在青岛隆重举行
获奖队伍名单
金奖
山东大学 多喝热水多看文档队
陈国良院士、吴立新院士、王英龙研究员为金奖获奖队颁奖
银奖
中国科学技术大学 鲲鹏队
中国科学院计算机网络信息中心 Hello World 队
袁国兴研究员、孙凝晖研究员为银奖获奖队颁奖
铜奖
中山大学 SYSU_ASC队
清华大学 四个程序员队
西北工业大学 西北工业大学高性能计算中心队
华东师范大学 ECNUCC队
成都信息工程大学 Quantum队
漆锋滨研究员、张云泉研究员、胡庆丰教授、莫则尧研究员、魏志强研究员为铜奖获奖队颁奖
赛区一等奖
成都信息工程大学 耦合队
中国地质大学（武汉）地大之光超算1队
中国地质大学（武汉）地大之光超算2队
清华大学 cjoier队
清华大学 Victorization队
山东科技大学 First_Blood队
北京理工大学 BIT Faster队
潘景山副主任、刘鑫研究员、肖侬教授为赛区一等奖获奖队颁奖
初赛英雄榜前三甲
中国地质大学（武汉） 地大之光超算1队
中国地质大学（武汉） 地大之光超算2队
山东科技大学 First Blood队
张玉教授、陈健博士为初赛英雄榜获奖队颁奖
专家点评
GromacsZ初是一个为了模拟复杂生物分子设计的分子动力学软件, 具有性能优异, 功能多样, 配套生态齐全等优势, 经历了长期的发展, Gromacs渐渐发展成为现代化的拥有数十万行代码大型应用, 也成为了目前Z受欢迎的分子动力学软件之一.
CPC2018选择分子动力学软件Gromacs作为决赛题目, 具有如下的难点:
1) 比赛时间短, 代码量大: Gromacs有数十万行代码, 而比赛的时间只有20几天, 参赛队需要快速在Gromacs中找到运行时的热点并进行深入的优化.
2) 算法优化难度大: 分子动力学存在访存随机, 通信压力大的特点, 而且在神威-太湖之光上的可以借鉴的前期实践较少, 参赛队需要进行足够的创新才能在国产CPU上获得好的优化效果.
3) 基于真实应用进行优化: Gromacs具有复杂的工程结构, 参赛队需要良好的软件工程能力才能将自己优化与Gromacs结合起来, 在不失去Gromacs真实应用意义的前提下展现自己的优化能力.
4) 测试用例各有侧重: 决赛提供的三个测试用例中, 离子通道算例会遇到负载均衡问题, 木质纤维在64进程下是计算和访存密集问题, 而在512进程下又会变成通信和IO密集问题, 这要求参赛队对应用进行足够细致的优化才能在比赛中脱颖而出.
这些都对参赛队造成了极大的困难, 经过20几天的激烈角逐, 参赛队们展现出了顽强的意志和丰富的智慧, 从开始无法完成源代码的编译, 到分析, 到尝试, 到看到优化的效果, 展现出了许多亮点:
1) 优化思路丰富: 参赛队对于解决赛题中存在的难点各显神通, 同样是对于Gromacs中访存随机的问题, 有的参赛对原子团的随机读写采用软件Cache的方法解决, 有的参赛队通过对原子团数据的打包整合, 将小块随机访存变成了更适合国产CPU的访存形式.
2) 优化程度深: 参赛队对于赛题中的热点进行了细致入微的优化, 例如非键力中计算代码虽然非常复杂, 但是很多参赛队实现了向量化, 甚至基于嵌入汇编的流水重排等技术, 获得了极好的计算性能.
3) 优化范围广: 参赛队不仅对于计算, 访存的部分进行了优化, 同时有的参赛队对于文件系统和网络负载较重的部分实现了绕过stdio单独实现缓冲, RDMA等技巧实现了有效的优化.
4) 动手能力强: 除了对于应用本身的优化之外, 有些参赛队为了更好地实现对于应用的分析与优化DIY了多种多样的工具, 极大地提升了应用分析与优化的效率.
Z终, 决赛队伍实现了对完整算例至多26倍的有效加速, 一方面展现出了自身的优化水平和竞技精神, 另一方面为类似算法在神威-太湖之光上的优化积累了宝贵经验.
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